Pourquoi prescrire un examen parasitologique des selles ?

Dans ma pratique à l'AP-HP, je vois souvent des patients souffrant de diarrhée persistante, de douleurs abdominales ou de ballonnements inexpliqués. L'examen parasitologique des selles (EPS) est alors un outil clé pour identifier la présence d'amibes, de parasites intestinaux ou de leurs œufs.

Qu'est-ce que la microscopie des selles pour amibes et parasites ?

Il s'agit d'une analyse microbiologique qui consiste à observer au microscope un échantillon de selles fraîches. On recherche des protozoaires (comme Entamoeba histolytica, responsable de l'amibiase), des helminthes (vers) ou leurs œufs. Le prélèvement doit être récent, idéalement avant toute prise d'antibiotiques ou d'antiparasitaires.

Comment se déroule le prélèvement ?

Rien de compliqué : il suffit de recueillir un peu de selles dans un pot stérile fourni par le laboratoire. Pour une fiabilité maximale, trois échantillons à 48 h d'intervalle sont souvent demandés, car l'émission de parasites peut être intermittente. Évitez les laxatifs, le kaolin et les produits de contraste récents.

Valeurs normales (référence en laboratoire)

Population	Résultat normal
Enfants et adultes	Absence de parasites, d'œufs, de kystes d'amibes pathogènes
Voyageurs en zone tropicale	Idem – une recherche spécifique peut être faite selon la clinique

Note : On tolère parfois des commensaux non pathogènes (ex. Entamoeba coli). L'interprétation est toujours clinique.

Interprétation des résultats

Un résultat positif identifie l'espèce responsable : amibes (trophozoïtes ou kystes), Giardia, Trichomonas, ascaris, oxyures, etc. Un résultat négatif n'exclut pas totalement une infection parasitaire : la sensibilité de l'examen est d'environ 70 % pour un seul prélèvement. D'où l'importance de répéter si les symptômes persistent.

Que faire en cas de résultat positif ?

Un traitement antiparasitaire adapté est prescrit (métronidazole pour l'amibiase, albendazole pour les helminthes, etc.). Un contrôle après traitement est souvent recommandé. Dans mon expérience, un suivi rapproché évite les rechutes.

L'examen parasitologique des selles chez l'enfant

Chez le nourrisson et l'enfant, les parasites intestinaux sont fréquents, surtout en collectivité. Les symptômes typiques sont une diarrhée chronique, un retard de croissance ou un prurit anal (oxyures). Le prélèvement se fait de la même manière, parfois à l'aide d'un adhésif anal spécifique pour les oxyures.

Précautions pendant la grossesse

Si vous êtes enceinte et présentez une diarrhée persistante, l'examen des selles est sans danger. Informez simplement votre médecin de votre grossesse. Certains traitements antiparasitaires sont contre-indiqués au premier trimestre ; le diagnostic précis permet de choisir la meilleure option.

LOINC et standardisation

Le code LOINC recommandé pour cet examen est 57904-3 (Microscopy of Stool for Parasites and Ova). Ce standard international facilite l'échange de données entre laboratoires, y compris en France.

Nos conseils pratiques

Ne pas utiliser de laxatifs ni de suppositoires avant le prélèvement.
Conserver l'échantillon au réfrigérateur (4 °C) et l'apporter au laboratoire dans les 2 heures.
Si vous voyagez récemment dans une zone tropicale, signalez-le à votre médecin.
Un résultat négatif ne signifie pas toujours l'absence de parasite : en cas de doute, une PCR sur selles ou une sérologie peuvent être utiles.

Examen parasitologique des selles (EPS)